Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Itga4Q00651 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itga4Q00651 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms