Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irx3P81067 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms