Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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