Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnrpfP62307 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms