Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P58686 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P58686 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P58686 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P58686 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P58686 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P58686 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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