Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GferP56213 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
GferP56213 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms