Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptx3P48759 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms