Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gbx2P48031 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms