Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms