Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms