Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Nedd1P33215 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nedd1P33215 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms