Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PparaP23204 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PparaP23204 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PparaP23204 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PparaP23204 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PparaP23204 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PparaP23204 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PparaP23204 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PparaP23204 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms