Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms