Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P18530 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P18530 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P18530 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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