Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18526 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18526 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18526 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18526 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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