Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DmdP11531 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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DmdP11531 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DmdP11531 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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