Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Copb2O55029 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Copb2O55029 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Copb2O55029 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Copb2O55029 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Copb2O55029 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Copb2O55029 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Copb2O55029 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Copb2O55029 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Copb2O55029 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Copb2O55029 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Copb2O55029 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Copb2O55029 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Copb2O55029 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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