Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Cited2O35740 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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