Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cited2O35740 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms