Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Eftud2O08810 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms