Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3727J3QM54 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3727J3QM54 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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