Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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