Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm42421F6X8D5 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms