Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Phf11bB4XVQ1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms