Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms