Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NhsB1AV60 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms