Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm3550W4VSN7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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