Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lgr5Q9Z1P4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lgr5Q9Z1P4 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lgr5Q9Z1P4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lgr5Q9Z1P4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lgr5Q9Z1P4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lgr5Q9Z1P4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lgr5Q9Z1P4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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