Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pfdn5Q9WU28 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pfdn5Q9WU28 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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