Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gpc6Q9R087 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms