Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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