Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tuba8Q9JJZ2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms