Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim54Q9ERP3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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