Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms