Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms