Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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MINDY3Q9CV28 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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MINDY3Q9CV28 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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MINDY3Q9CV28 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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MINDY3Q9CV28 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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MINDY3Q9CV28 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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MINDY3Q9CV28 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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MINDY3Q9CV28 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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MINDY3Q9CV28 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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MINDY3Q9CV28 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
MINDY3Q9CV28 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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