Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms