Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp16Q99LG0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms