Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CsprsQ99388 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms