Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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