Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trim59Q922Y2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trim59Q922Y2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trim59Q922Y2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trim59Q922Y2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trim59Q922Y2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trim59Q922Y2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trim59Q922Y2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trim59Q922Y2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim59Q922Y2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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