Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Mtmr3Q8K296 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Mtmr3Q8K296 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Mtmr3Q8K296 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mtmr3Q8K296 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Mtmr3Q8K296 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Mtmr3Q8K296 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mtmr3Q8K296 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mtmr3Q8K296 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mtmr3Q8K296 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mtmr3Q8K296 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mtmr3Q8K296 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mtmr3Q8K296 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mtmr3Q8K296 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms