Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab11fip3Q8CHD8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rab11fip3Q8CHD8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms