Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms