Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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