Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf187Q8BFX1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf187Q8BFX1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf187Q8BFX1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf187Q8BFX1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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