Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms