Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trim37Q6PCX9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trim37Q6PCX9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trim37Q6PCX9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trim37Q6PCX9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trim37Q6PCX9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim37Q6PCX9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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