Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms