Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkp4Q68FH0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms