Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vdac3Q60931 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vdac3Q60931 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms